دانشگاه علوم اقتصادی به عنوان نخستین مرکز آموزشی وزارت امور اقتصادی و دارایی در سال ۱۳۱۵ بنیانگذاری شد. مجوز تاسیس این دانشگاه با عنوان «دانشکده امور اقتصادی و دارایی» در شهریور ۱۳۶۶ توسط وزارت فرهنگ و آموزش عالی صادر گردید.
هدف این دانشکده، تربیت مدیران مالی مورد نیاز کشور و آموزش و تربیت مدیران مورد نیاز وزارت امور اقتصادی و دارایی و سازمان‏های تابعه با رشته‏ های میان رشته‏ ای و کاربردی بود.
از جمله رشته‏ های این دانشکده می ‏توان به علوم اقتصادی با سه گرایش، مدیریت بانکداری، مدیریت گمرک، مدیریت بیمه، حسابداری با چهار گرایش، مدیریت کسب و کار با هشت گرایش، مدیریت بازرگانی، و مدیریت صنعتی اشاره کرد که با مجوز وزارت علوم، تحقیقات و فناوری از طریق کنکور سراسری پذیرش دانشجو داشت.
این دانشکده در سال ۱۳۸۲، با مصوبه شورای عالی اداری از وزارت امور اقتصادی و دارایی منفک گردید و تحت پوشش وزارت علوم، تحقیقات و فناوری قرار گرفت. «دانشکده امور اقتصادی و دارایی» در سال  ۱۳۸۶  به دانشکده علوم اقتصادی تغییر نام داد. این دانشکده در سال ۱۳۹۰ با ایجاد دانشکده‏ های اقتصاد، علوم مالی، و مدیریت به دانشگاه علوم اقتصادی ارتقاء یافت.
به دنبال ادغام دانشگاه علوم اقتصادی با دانشگاه خوارزمی در اسفندماه ۱۳۹۳ که با مصوبه شورای گسترش آموزش عالی انجام پذیرفت، دانشکده ‏های مدیریت هر دو دانشگاه در هم ادغام شدند.
در حال حاضر دانشکده مدیریت با ۵ گروه آموزشی تحت عنوان گروه بانک، بیمه و گمرک، گروه مدیریت بازرگانی، گروه مدیریت کسب و کار، گروه مدیریت منابع انسانی، و گروه مدیریت عملیات و فناوری اطلاعات در رشته‏ های کارشناسی، کارشناسی ارشد و دکتری فعالیت می‏ نماید.